Déterminants de la charge virale nasopharyngée chez les patients infectés par un virus grippal, consultant en soins primaire : 2010–2018

Introduction La grippe est un probleme de sante publique persistant compte tenu d’epidemies saisonnieres recurrentes qui justifient une surveillance epidemique et virologique. La detection de virus par RT-qPCR, largement utilisee pour la surveillance, est principalement un outil diagnostique qualitatif, mais permet egalement une estimation de la charge virale. Nous avons analyse les facteurs associes au niveau estime de charge virale nasopharyngee de patients consultant en soins primaires avec un diagnostic d’infection par un virus grippal confirme. Materiels et methodes Les patients recrutes par le reseau de surveillance en soins primaires durant les saisons 2010–2011 a 2017–2018 pour lesquels un ecouvillonnage nasopharynge etait positif pour un virus de type A ou de type B, diagnostique par RT-qPCR, etaient inclus. Pour chaque patient, des donnees epidemiologiques et cliniques etaient collectees. Les analyses par RT-qPCR, permettaient l’identification du virus et l’estimation de la charge virale. Les facteurs associes au niveau de charge virale etaient identifies par regression lineaire et ceux associes a la severite (presence d’une dyspnee ou hospitalisation) par regression logistique. Resultats Sur l’ensemble des saisons, 6297 patients ont ete inclus dans l’analyse. La proportion d’hommes etait de 50,7 %, l’âge median (intervalle inter quartile) au diagnostic etait de 20 ans (6–43). Le virus grippal etait A(H1N1)pdm09 chez 1722 (27,4 %) patients, A(H3N2) chez 2184 (34,7 %) patients et B chez 2345 (37,2 %) patients. En analyse multivariee, les patients infectes par des virus de type A(H3N2) et B presentaient des charges virales significativement plus elevees que les patients infectes par des virus de type A(H1N1)pdm09 (p  Conclusion Apres ajustement pour les facteurs confondants parmi lesquels le type de virus, des fluctuations persistaient d’une saison a l’autre, sans explications pertinente a ce jour. On remarque cependant que les saisons associees aux plus faibles charges virales sont les saisons pendant lesquelles les 3 virus co-circulaient.