Asociación entre haplotipos del gen il1b y el riesgo de cáncer colorrectal en poblaciones colombianas: un estudio de casos y controles

Introduccion Los polimorfismos de un solo nucleotido (SNPs) en citoquinas pueden afectar la expresion genica favoreciendo procesos de inflamacion y carcinogenesis. Hay resultados contradictorios con respecto a la asociacion entre marcadores en el gen de IL1B con cancer colorrectal (CCR). La mayoria de los reportes sobre esta asociacion han analizado el efecto de SNPs individuales. Sin embargo, existe evidencia sobre la importancia de estudiar el contexto haplotipico con el fin de entender mejor el efecto de estas variables en la expresion del gen y el CCR. Objetivo Evaluar la asociacion entre el CCR y polipos adenomatosos (PA) con haplotipos del gen de IL1B en poblaciones colombianas. Materiales y metodos Se reclutaron 317 CCR, 199 PA y 511 controles (pareados por edad y sexo) en 6 ciudades colombianas con diferente riesgo para CCR, como parte de un estudio multicentrico de casos y controles dirigido a la identificacion de factores de riesgo ambientales y geneticos para CCR en nuestro pais. Los participantes firmaron un consentimiento informado, donaron muestras de sangre y respondieron cuestionarios. Se genotiparon 5 SNPs del gen de IL1B (−3737, −1464, −511, −31 y +3954) mediante Taqman ® SNP Genotyping Assays. Se calculo el equilibrio de Hardy-Weinberg (HWE) y se realizaron los analisis estadisticos usando regresion logistica condicional ajustando por factores de riesgo y ancestria. El desequilibrio de ligamiento (LD) fue calculado usando Haploview 4.0 mediante los estadisticos D′ y r 2 . Los analisis de haplotipos se realizaron en STATA v11.0 bajo un modelo aditivo. Este estudio fue aprobado por el Comite de Etica del Instituto Nacional de Cancerologia. Resultados Los controles se encontraron en HWE (p > 0,05). Encontramos un bloque haplotipico que incluyo los cuatro SNPs de la region promotora del gen de IL1B . Los SNPs IL1B-31 e IL1B-511 se encontraron en perfecto LD (D′: 0,998; r 2 : 0,948), es decir, que son TagSNPs. Bajo un modelo aditivo, encontramos una asociacion entre el haplotipo -3737C/-1464G/-511T/-31C y el riesgo de CCR (p  Conclusiones Existe una asociacion positiva entre el haplotipo -3737C/-1464G/-511T/-31C y el riesgo de CCR en la poblacion colombiana.