Characterization of eastern equine encephalitis virus by reverse transcriptase polymerase chain reaction and analysis of single strand conformation polymorphisms.

El analisis de polimorfismo en la conformacion de cadenas sencillas (SSCP, por sus siglas en ingles) se utilizo para caracterizar regiones del genoma de tres cepas de virus de encefalitis equina del este (VEEE), aisladas de cerebros de equinos muertos. Los segmentos de ARN fueron amplificados mediante la transcriptasa reversa acoplada a la reaccion en cadena de la polimerasa (RT-PCR). Se analizo un fragmento de 542 pb de la region 3’no traducible del ARNm 26S y un fragmento de 532 pb del gen de la proteina no estructural P4 (nsP4), encontrandose que la migracion de las cadenas sencillas de estos fragmentos de ADNc fueron diferentes en estos aislados virales, lo que indica que presentan polimorfismo genetico en estas regiones del genoma, el cual es caracteristico de cepas de VEEE, variantes Sur Americanas.