Bilan de l'utilisation en routine de la spectrométrie de masse dans un laboratoire hospitalier de microbiologie

Resume But de l’etude La technique Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation Time Of Flight (MALDI-TOF) est en plein essor. Elle permet d’obtenir un spectre des proteines ribosomales et de membranes en fonction de leur poids, ce spectre compare a une base de donnees permet d’identifier les microorganismes. Le laboratoire de microbiologie du centre hospitalier de Mulhouse a fait l’acquisition de cette technique en mai 2009. Methode Nous avons utilise le spectrometre de masse Axima ® (Shimatzu) couple au logiciel Saramis ® (Anagnostec), l’integration a l’informatique du laboratoire se faisant via le logiciel SirWeb ® (societe I2A). La majorite des souches isolees dans le laboratoire a ete analysee en spectrometrie. Resultats La technique a rapidement ete acquise par l’ensemble du personnel du laboratoire. Pendant cette etude, 98,8 % des isolats analyses ont ete identifies jusqu’a l’espece, voire la sous espece. Le recours a une autre technique, essentiellement la biologie moleculaire a rarement ete necessaire, ce recours etant limite aux isolats cliniquement significatifs. L’utilisation de la spectrometrie de masse permet une identification rapide et precise de la majorite des microorganismes rencontres dans notre activite. La base Saramis comprend des especes rares et d’identification fastidieuse par les techniques classiques, certaines lacunes sont a combler. Les superspectres, specifiques de la base Saramis ® permettent une validation technique tres fiable. Conclusion La spectrometrie de masse s’est donc parfaitement integree a notre activite de routine, l’identification et l’antibiogramme se faisant plus souvent a partir d’une seule colonie. La coloration de Gram et les tests simples gardent tout leur interet.