La PCR multiplex : un outil diagnostic d’infection respiratoire basse chez l’adulte

L’identification des agents pathogenes est importante pour la mise en œuvre d’un traitement adapte des infections respiratoires basses (IRB) mais les methodes diagnostic classiques sont souvent mises en defaut. Nous rapportons l’impact sur la pratique clinique de l’utilisation de la PCR multiplex pour la detection de 18 virus et 4 bacteries. Entre janvier 2012 et avril 2014, une PCR multiplex a ete realisee sur aspiration nasopharyngee chez tous les patients adultes hospitalises pour une IRB dans le service de maladies infectieuses du CHU de Tours. Sur 133 patients testes, un pathogene a ete identifie chez 72 patients (54 %) dont 4 cas avec un Mycoplasma pneumoniae . Les 68 autres identifications etaient des virus avec Myxovirus influenzae A (22 patients), Rhino/enterovirus (16), Coronavirus (11), Bocavirus (11), Metapneumovirus (6), virus syncitial respiratoire (4), Adenovirus (4), Myxovirus influenzae B (3) et Paramyxovirus influenzae (2). Avec les methodes classiques, un agent pathogene a ete identifie dans 6 cas : 3 Streptococcus pneumoniae et 3 Mycoplasma pneumoniae . Lorsqu’un virus a ete identifie comme cause de l’IRB, la radiographie pulmonaire montrait un syndrome alveolaire dans 21 cas. L’identification d’un agent viral par PCR multiplex a permis un arret anticipe de l’antibiotherapie chez 14 patients et l’absence d’initiation d’un antibiotique chez 6 autres patients. La PCR multiplex est utile pour l’identification microbiologique des infections respiratoires virales (54 %) et pour la prise en charge des patients en limitant la prescription inappropriee d’antibiotique (15 % d’arret ou de non prescription).