Décryptage des mécanismes biologiques impliques dans le bio contrôle des champignons mycotoxinogènes des céréales. Poster communications - P20

Les mycotoxines sont des metabolites secondaires toxiques synthetises par des moisissures qui contaminent de nombreuses denrees d'origine vegetale, notamment les cereales qui sont le premier facteur d'exposition des consommateurs a ces molecules presentant un reel risque pour la sante humaine et animale. En particulier, les especes Fusarium graminearum et Fusarium verticillioides sont responsables de la production de mycotoxines de type trichothecenes et fumonisines respectivement, et leurs incidences sur les productions de ble et de mais en pre- et post-recolte sont bien connus. Pour lutter contre ces champignons, une strategie alternative aux produits phytosanitaires est l'utilisation de microorganismes antagonistes qui par differents mecanismes vont reduire la progression de ces champignons et limiter l'accumulation de mycotoxines. Cependant, la mise en place de telles methodes de protection necessite une bonne connaissance des mecanismes biologiques qui regissent l'interaction entre les moisissure mycotoxinogenes et les agents de biocontrole (BCA), afin de favoriser les phenomenes d'antagonismes mais aussi pour faciliter la selection de nouveaux candidats de biocontrole en fonctions des processus les plus prometteurs. La finalite de cette etude est donc d'utiliser les technologies meta-omiques, notamment la transcriptomique et la metabolomique afin de : (i) decrypter les mecanismes impliques dans le biocontrole des moisissures toxinogenes pour comprendre comment les BCA potentiels interviennent, (ii) identifier des biomarqueurs (gene cle ou metabolite) inhibiteurs de la mycotoxinogenese pour optimiser le screening de BCA, (iii) optimiser leur usage et evaluer les possibilites de regulation des populations microbiennes pour favoriser les phenomenes d'antagonisme par des itineraires techniques optimises. En vue de ces objectifs, des BCA commerciaux et de la collection de l'UMR QualiSud ont ete selectionnes, caracterises et etudies en confrontation in vitro avec ces pathogenes du genre Fusarium et ont permis de proposer une ou plusieurs hypotheses concernant leur mode d'action et sur la maniere dont la physiologie des Fusaria est impactee. L'etude de la confrontation des couples BCA-pathogene a ete completee sur epillets grâce a une methode innovante de screening, puis la question de la transposition vers la plante entiere sera investiguee. L'analyse du transcriptome et du metabolome des differents systemes plantes-pathogenes-BCAs permettra d'explorer quels genes sont differentiellement exprimes en confrontation, quelles voies biologiques sont impliquees lors de cette reponse, et quelles sont les signatures de ces mecanismes antagonistes (signaux VIP issus des meta-omic : genes ou metabolites). L'identification de ces biomarqueurs servira a faire emerger de nouveaux BCAs antimycotoxinogenes pour de futures etudes de developpement ou autorisations de mise sur le marche (AMM). D'une maniere globale, les resultats de cette etude pourront contribuer a limiter l'accumulation des mycotoxines dans les cereales ainsi que les residus de produits phytosanitaires, ce qui est un double objectif de securite sanitaire.