Diversidad genética de habitantes de la provincia de Loja-Ecuador / Genetic diversity of inhabitants of the province Loja-Ecuador

Las poblaciones humanas de Latinoamerica se caracterizan por estar mezcladas con aportes geneticos de indigenas, colonizadores europeos y africanos traidos como esclavos. Como resultado de esta mezcla, Ecuador posee una gran heterogeneidad en su poblacion. Esto ha sido de interes en el analisis de la variabilidad genetica de este pais. El objetivo de este trabajo fue caracterizar geneticamente individuos pertenecientes a la etnia Saraguro y habitantes de otros cantones de la provincia de Loja, Ecuador.  Para ello,  se analizaron  15  loci  microsatelites en 435 individuos no relacionados,  60 de Saraguro y 375 del resto de la provincia de Loja. Se realizo una comparacion entre ambos grupos, mediante la determinacion de los indices de diversidad genetica (numero de alelos, numero de alelos efectivos, indice de contenido polimorfico, riqueza alelica, heterocigosidad observada y esperada). Se calcularon las frecuencias alelicas y los indices de diversidad de Nei (diversidad genetica total y diversidad genetica entre grupos). Se comprobaron las premisas de equilibrio genetico y desequilibrio de ligamiento. Se infirio la posibilidad de estructura genetica con el Analisis de Coordenadas Principales, el programa Structure, el valor del estadistico F ST y el Analisis Molecular de Varianza. Los indices de diversidad genetica mostraron mayores valores para Loja, excepto para la riqueza alelica donde las diferencias encontradas no fueron significativas. El locus FGA aporto mas a la variacion genetica total, mientras que D18S51 lo hizo, a la variacion entre grupos. La poblacion de Saraguro se encontro en equilibrio genetico, mientras que la poblacion de Loja no. Algunos loci mostraron equilibrio de ligamiento, pero no producto del ligamiento fisico, ya que se localizan en cromosomas diferentes o alejados entre si. No se obtuvo estructura genetica para la poblacion de Saraguro y Loja, tal vez, por una mezcla entre ellos o un origen comun para ambas localidades estudiadas. Este origen comun podria ser Quichua, o producto de su mezcla con poblaciones espanolas que llegaron a Ecuador durante la conquista a los que se sumaron judios que se asentaron principalmente en la provincia de Loja. Palabras clave: estructura genetica, microsatelites, Saraguro Abstract The human populations of Latin America have genetic contributions of indigenous, European colonizers and Africans brought as slaves. Because of this mixture, Ecuador has a great heterogeneity in its population. This has been of interest in the analysis of the genetic variability of this country. The objective of this work was to genetically characterize individuals belonging to the Saraguro ethnic group and inhabitants of other cantons of the province of Loja, Ecuador. We analyzed fifteen microsatellite loci in 435 unrelated individuals, 60 of Saraguro and 375 of the rest of the province of Loja. The two groups were compare by determining the genetic diversity indexes (number of alleles, number of effective alleles, index of polymorphic content, allelic richness, observed and expected heterozygosity). Allelic frequencies and Nei diversity indexes (total genetic diversity and genetic diversity between groups) were calculated. We checked the premises of genetic balance and linkage disequilibrium. We inferred the possibility of genetic structure with the Principal Coordinate Analysis, the Structure program, the value of the F ST statistic and the Molecular Analysis of Variance. The rates of genetic diversity showed higher values for Loja, except for the allelic richness where the differences found were not significant. The FGA locus contributed more to the total genetic variation, whereas D18S51 did, to the variation between groups. The population of Saraguro was found in genetic equilibrium, while the population of Loja was not. Some loci showed linkage equilibrium, but not the product of the physical linkage, since they are located on different or distant chromosomes. No genetic structure was obtained for the population of Saraguro and Loja, perhaps due to a mixture between them or a common origin for both localities studied. This common origin could be Quichua, or product of its mixture with Spanish populations that arrived at Ecuador during the conquest, also added Jews that settled mainly in the province of Loja. Keywords: genetic structure; microsatellites; Saraguro.