Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L

Горох посевной ( Pisum sativum L.) способен вступать в симбиотические отношения с азотфиксирующими бактериями из группы ризобий ( Rhizobia ). В обмен на питательные вещества бактерии поставляют фиксированный азот, необходимый для поддержания роста растения. Фиксация азота происходит в специализированных органах — клубеньках. Формирование и функционирование клубенька — сложноорганизованный процесс, требующий тонкой регуляции работы генов. Один из ее механизмов — альтернативный сплайсинг (АС). На данный момент информация о роли АС в установлении и поддержании симбиотических отношений между азотфиксирующими бактериями и бобовыми растениями практически отсутствует, но известно, что это мощный способ регуляции разнообразия протеома клетки, а потому АС наблюдается в реакциях на присутствие микросимбионта. В рамках работы был проведен анализ событий АС в клубеньках и кончиках корней гороха посевного. Показано, что среди функциональных групп генов, демонстрирующих события АС, одной из наиболее представленных является группа, принимающая участие в стрессовых реакциях растения на патогены. Вероятно, транскрипты с удержанным интроном подвергаются воздействию NMD-системы либо меняют свою функцию вследствие изменения первичной и вторичной структуры. Также выявлена in silico , экспериментально подтверждена и оценена количественно с применением метода ПЦР в реальном времени представленность мРНК изоформ четырех генов гороха: PsIGN1 , PsSIP1 , PsPR-10 , PsWRKY40 .