樟树4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶基因的克隆及表达分析

4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶（4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase,CMK）是植物萜类化合物生物合成途径甲基赤藓醇-4-磷酸途径（methylerythritol-4-phosphate pathway,DXP/MEP）上的第4个关键酶。该研究根据樟树转录组数据,利用RT-PCR（reverse transcription-PCR）方法从药用植物樟树Cinnamomum camphora中克隆得到4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶基因,命名为Cc CMK1（Gene Bank登录号Ku376098）,对其序列进行生物信息学分析,结果表明该基因开放阅读框（ORF）为1 212 bp,编码403个氨基酸,推测其相对分子质量为44.46 k Da,等电点（theoretical p I）为4.99。跨膜结构分析表明CMK蛋白不存在跨膜结构。信号肽分析表明其为非分泌蛋白,不存在信号肽。亚细胞定位表明其定位于叶绿体中。利用荧光实时PCR检测了龙脑樟、油樟、芳樟、脑樟和异樟5种化学型樟树中Cc CMK1基因的表达量,结果表明Cc CMK1基因在油樟中的表达量最高,龙脑樟中表达量最低,为樟树萜类化合物生物合成途径关键酶基因元件挖掘提供研究基础。