Quel a été le processus d'émergence de Phytophthora Megakarya sur cacaoyer au Cameroun ?

Au Cameroun, la principale espece responsable de la pourriture brune des cabosses du cacaoy~r (Theobroma cacao L.) est Phytophthora. megakarya. Cet agent pathogene detruit en moyenne 50 % de la production camerounaise de cabosses. Depuis le debut des annees 1920, cette espece a colonisee toute l'Afrique Centrale et continue son expansion en direction de l'Afrique de l'Ouest. EUe remplace progressivement P. palmivora. Elle a atteint en 2008, l'Ouest de la Cote d'Ivoire, la premiere zone de production de cacao mondiale. De ce fait elle represente la plus grande menace phytosanitaire pour le marche cacao mondial. Toutefois P. megakarya a ete isole uniquement en Afrique alors que le cacaoyer est originaire d'Amerique. Alors qu'elle est l'origine et le processus d'emergence de cette espece? Apres des recherches bibliographiques approfondies et nos propres travaux concernant la diversite genetique de ce parasite, il semble que deux hypotheses de mecanismes d'emergence soient possibles. Dans le cadre d'un projet ANR francais " Emerfundis " (2008-2010), les deux hypotheses vont etre testees en collaboration avec l'IRAD Cameroun. Les deux hypotheses de mecanismes d'emergence sont les suivantes: ---soit un saut d'hote d'une plante hote originelle endemique du Cameroun sur cacaoyer au moment de son introduction au Cameroun dans les annees 1890-1900. Des prospections dans les zones putatives d'origines de P. megakarya (zone Bipendi et Fako) sont en cours de realisation afin d'une part de trouver la plante hote originelle et d'autre part de confinner que le maximum de diversite genetique se situe bien dans ces zones d'origines putatives. Les souches sont transferees et caracterisees au Cirad Montpellier par AFLP, RAPD et microsatellites. ---soit par evolution genetique: P. megakarya pourrait venir de la fusion de chromosomes de P. palmivora . Cette derniere espece possede 10 a 12 chromosomes qui par un phenomene de fusion Robertsoniene par centromere auraient pu donner les 5 a 6 gros chromosomes de P. megakarya. La comparaison de marqueurs sur chromosomes des 2 especes par la Technique M-Fish est en cours de realisation au Cirad Montpellier. En complement, les cartes genetiques de P. megakarya et de P. palmivora sont en cours de realisation afin de comparer les groupes de liaisons des deux especes. Ces travaux nous penneitront de mieux comprendre l'evolution de ce pathogene au Cameroun sur cacaoyer et d'eviter certaines associations culturales qui favoriseraient le passage de certaines plantes porteuses de P. megakarya sur cacaoyer si 1'hypothese 1 est verifiee. Ils pennettront egalement d'expliquer pourquoi le remplacement de P. palmivora par cette nouvelle espece se fait aussi rapidement en Afrique, si l'hypothese de fusion de chromosomes est verifiee. (Texte integral)