致犊牛脑膜炎大肠杆菌新疆分离株 ibeB 基因的特性分析

目的 分析致犊牛脑膜炎大肠杆菌分离株 ibeB 基因的分子生物学信息。 方法 以自脑炎死亡犊牛脑组织、肝组织分离鉴定的O161-K99-STa致病性大肠杆菌牛-EN株和牛-EG分离株为材料。根据GenBank中公布的脑膜炎大肠杆菌K1株RS218 ibeB 基因序列设计1对引物,采用PCR方法,从分离株中成功克隆 ibeB 基因,比较分离株 ibeB 基因与不同来源大肠杆菌 ibeB 基因的部分生物信息学特性。 结果 分离株 ibeB 基因序列全长1500 bp,包含1371 bp开放阅读框,共编码457个氨基酸;生物信息学分析显示,牛-EN株与致人脑膜炎大肠杆菌K1 RS218的核苷酸和氨基酸同源性分别为90.5%和96.9%,牛-EG株与大肠杆菌K12的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.4%和100.0%; ibeB 蛋白为亲水性蛋白,分子质量为50.26 kDa,理论等电点为6.05;该蛋白无跨膜区,但具有信号肽序列;亚细胞定位显示,分泌信号通路位点(SP)占比例为0.939,说明该蛋白属于分泌型蛋白。 结论 从致脑膜炎大肠杆菌分离株中成功克隆 ibeB 基因,该基因与致人脑膜炎大肠杆菌K1 RS218 ibeB 基因有较高的同源性,均有相似的生物学特性,属肠外致病性大肠杆菌。