SNP identification and validation in two invasive species: zebra mussel (Dreissena polymorpha) and Asian clam (Corbicula fluminea)
2019
espanolEl desarrollo de las plataformas asequibles de secuenciacion masiva en paralelo (SMP) ha reducido el coste y el tiempo en la identificacion de marcadores de polimorfismos de nucleotido unico (PNU) para su uso en estudios de genetica de poblaciones y de conservacion. Tras la SMP, suele ser necesaria una segunda validacion. El analisis de las curvas de fusion a alta resolucion (HRMA en su sigla en ingles) es un metodo rapido y sencillo para escanear mutaciones y, por tanto, es un protocolo adecuado de validacion de dichos marcadores, especialmente en especies no modelo. En este trabajo se presenta un juego de nueve marcadores polimorficos de PNU nuevos identificados mediante SMP y validados con el HRMA en dos especies invasoras (el mejillon cebra Dreissena polymorpha y la almeja asiatica Corbicula fluminea), que pueden utilizarse en estudios de genetica de poblaciones para evaluar y entender correctamente los episodios de invasion pasados y los que podrian ocurrir en el futuro. EnglishThe development of affordable massive parallel sequencing (MPS) has reduced both time and costs of SNP identification for use in conservation and population genetic studies. After MPS, a second validation is usually required. High resolution melting analysis (HRMA) is a fast and simple method for mutation scanning, and thus a suitable validation protocol, particularly in non–model species. We present a set of nine novel polymorphic SNPs identified by MPS and validated with HRMA in two invasive species (the zebra mussel Dreissena polymorpha and the Asian clam Corbicula fluminea). These SNPs can be used in genetic studies to accurately assess and understand past and future invasion events.
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