水芹咖啡酰辅酶A- O -甲基转移酶基因的克隆与表达特性分析

目的本文旨在研究水芹咖啡酰辅酶A- O -甲基转移酶基因（ OjCCoAOMT ）的序列及其表达特性，了解该基因在水芹木质素代谢中的作用。 方法利用RT-PCR技术从水芹中克隆 OjCCoAOMT 基因，用生物信息学方法对获得的序列进行分析，并利用实时荧光定量PCR技术研究该基因在水芹不同组织以及不同贮藏条件下的表达。 结果序列分析结果表明： OjCCoAOMT 基因包含1个长度为726 bp的开放阅读框（ORF），编码241个氨基酸，蛋白相对分子质量为27.111×10 3 ，理论等电点为5.38。OjCCoAOMT蛋白属于疏水性蛋白，无序化比例为12.45%，空间结构主要由8个 α -螺旋和7个 β -折叠组成。多重比对与系统树分析结果表明：OjCCoAOMT蛋白与同科植物欧芹的进化关系最近。实时荧光定量PCR显示，在‘八卦洲水芹’和‘南选八卦洲紫水芹’的叶片及叶柄中 OjCCoAOMT 基因的表达量差异显著。在室温（25℃）、低温（4℃）和室温黑暗（25℃）3种贮藏条件下 OjCCoAOMT 基因表达量差异较大，低温（4℃）下表达量最高。2个品种的基因表达量也具有显著差异。 结论OjCCoAOMT蛋白有较高的保守性。 OjCCoAOMT 基因在水芹中的表达具有明显的组织特异性和材料差异性，同时在低温（4℃）条件下表达量最高。