Biostructure fonctionnelle du microbiote colique (zone de fermentation centrale, zone de réserve germinale et couche de mucus séparatrice) chez les sujets sains et chez les patients atteints de diarrhée traités par Saccharomyces boulardii☆

Resume Le contenu du colon peut etre compare a un bioreacteur a haut rendement dote d’une structure spatiale comportant trois regions fonctionnellement differentes : une couche de mucus separatrice, une zone germinale de reserve et une zone centrale de fermentation. Les selles refletent cette structure et peuvent etre utilisees comme un outil diagnostique chez le sujet sain ou malade. Dans la premiere partie, nous introduisons une methode innovante fondee sur l’etude par hybridation in situ (HIS) de coupes de selles prelevees par carottage, ce qui permet une evaluation quantitative du microbiote dans le mucus, dans la zone de reserve germinale et dans la zone centrale de fermentation. Dans la seconde partie, nous demontrons la mise en œuvre pratique de cette methode en decrivant la biostructure du microbiote fecal chez des sujets sains et chez des patients atteints de diarrhee chronique idiopathique traites par Saccharomyces boulardii . Des carottes de selles de 20 patients souffrant de diarrhee chronique idiopathique et de 20 temoins sains ont ete etudiees par la methode d’HIS. Soixante-treize groupes bacteriens ont ete evalues. Les fluctuations dans l’organisation de 11 groupes bacteriens constitutifs ont ete mesurees chaque semaine pendant trois semaines avant, trois semaines pendant et trois semaines apres une supplementation orale par Saccharomyces boulardii . Les constatations typiques chez les sujets sains etaient une couche de mucus separatrice de 5-60 μm, une distribution et une fluorescence homogenes, de fortes concentrations (>10 × 10 10 bacteries/ml) des trois groupes bacteriens habituels – Bacteroides, Roseburia et Faecalibacterium prausnitzii – et de faibles concentrations des groupes bacteriens occasionnels. Au cours de la diarrhee etait constatee une augmentation d’epaisseur de la couche protectrice de mucus, son incorporation aux selles, une reduction des concentrations des groupes bacteriens habituels, une inhibition du metabolisme bacterien dans la zone centrale de fermentation (extinction d’hybridation), une stratification de la structure des selles par des substances aqueuses et une augmentation compensatoire des concentrations des groupes bacteriens occasionnels. Les symptomes microbiens et cliniques de la diarrhee ont ete reversibles avec le traitement par Saccharomyces boulardii . L’analyse du rapport structure/fonction du microbiote fecal permet de caracteriser et de surveiller sur des criteres quantitatifs la dysfonction colique et sa reponse au traitement. Saccharomyces boulardii ameliore significativement la biostructure des feces au cours de la diarrhee chronique idiopathique et n’a pas d’effets sur le microbiote fecal des sujets sains.