Diversité génétique d’un génotype rare du virus de l’hépatite A

Resume But de l’etude Le genotype II du virus de l’hepatite A (VHA) est rarement isole. Entre 2002 et 2007, le centre national de Reference du VHA dans le cadre de son observatoire a identifie six souches de sous-genotype IIA. Un seul patient avait voyage hors metropole, au Benin. Dans l’hypothese d’une origine africaine de ce sous-genotype, nous avons determine sa prevalence parmi les souches isolees en 2008 chez les voyageurs au retour d’Afrique, puis caracterise sa variabilite genetique. Patients et methodes Les serums ont ete collectes grâce aux donnees de la declaration obligatoire. Le genotype viral a ete determine a partir de l’analyse phylogenetique de la region VP1/2A. La region P1 a ete caracterisee pour comparer la diversite genetique du genotype II a celle des autres genotypes. Resultats En 2008, cinq sur 54 des souches importees d’Afrique de l’ouest etaient de sous-genotype IIA. De plus, une souche « autochtone » et deux souches africaines ont ete isolees respectivement en 2008 et 2009. Au total, 14 isolats (huit Africains et six « autochtones ») ont ete analyses. La diversite genetique du genotype II est plus faible que celle des autres genotypes. L’analyse phylogenetique a differencie deux regroupements : l’un incluant uniquement des souches « autochtones » et l’autre comprenant les souches africaines et deux souches « autochtones ». Conclusion La majorite des souches de sous-genotype IIA isolees en France ont ete importees d’Afrique de l’ouest. Le mode de contamination inconnu pour deux tiers des cas « autochtones » suggere une autre origine geographique ou un reservoir francais a decouvrir.