การตรวจสอบความหลากหลายทางพันธุกรรมของ Stachytarpheta jamaicensis (L.) Vahl โดยใช้เทคนิค High Annealing Temperature - RAPD (HAT-RAPD) Genetic Polymorphisms of Stachytarpheta jamaicensis (L.) Vahl based on a High Annealing Temperature RAPD (HAT-RAPD)

2014 
การตรวจสอบรปแบบพนธกรรมของ Stachytarpheta jamaicensis ดวยเทคนค HAT-RAPD  ใหความหลากหลายของ แถบดเอนเอ (polymorphic band) จานวน 17 แถบ ซงมขนาด 300 ถง 1,500 bp  และใหรปแบบ haplotype จำนวน 19 แบบ เมอวเคราะหความหลากหลายทางพนธกรรมของ S. jamaicensis พบวา กลมประชากร S. jamaicensis ในจงหวดนครนายก มคา % polymorphic band และ expected heterozygosity มากทสด (P =  64.71%  และ H e = 0.224) รองลงมากลมประชากรในจงหวดสระแกว (P =  29.41% และ H e = 0.080) และกลมประชากรในจงหวดหนองคาย (P = 17.65  %  และ H e = 0.066)  นอกจากนนสายสมพนธววฒนาการ Neighbor-joining trees ทวเคราะหจาก Nei’s genetic distance สามารถแบง S. jamaicensis เปน 2 กลม ไดแก กลมประชากร ในจงหวดนครนายกและปทมธาน และกลมประชากรในจงหวดสระแกวและหนองคาย ผลการวเคราะห AMOVA ยนยนการมโครงสรางพนธกรรมภายในชนด S. jamaicensis ทใชในการศกษา และยงแสดงความแตกตางทางพนธกรรมระหวางกลมประชากรในจงหวดนครนายกและปทมธาน และกลมประชากรในจงหวดสระแกวและหนองคาย ( Φ RT = 0.248)   ความแตกตางระหวางประชากรทง 4 กลม  ( Φ PR = 0.493) และระหวางตวอยางภายในกลมประชากร ( Φ PT = 0.619) The genetic patterns of   Stachytarpheta jamaicensis were determined by using HAT-RAPD markers. Seventeen polymorphic HAT-RAPD markers showed a length from 300 to 1,500 bp, and nineteen haplotypes were obtained. The genetic diversity of S. jamaicensis was indicated  by the percentages of polymorphic bands and the values of expected heterozygosity showing the greatest in Nakorn Nayok populations (P =  64.71% and H e = 0.224), and the lowest in other populations (P =  11.76% and H e = 0.048  for Pathum Thani, P =  29.41% and H e = 0.080 for Srakaew, P = 17.65  %, and H e = 0.066 for Nong Khai).  The Neighbor-joining tree from Nei’s genetic distances demonstrated two groups of S. jamaicensis , one consisted of  Nakorn Nayok and Pathum Thani populations  and other consisted of  Srakaew  and Nong Khai populations. The AMOVA result confirmed the existence of intra-specific genetic structure in S. jamaicensis populations used in this study. Moreover, the genetic differentiations were significantly found between the two geographic regions:  Nakorn Nayok and Pathum Thani  group and  Srakaew  and Nong Khai group ( Φ RT = 0.248), among populations ( Φ PR = 0.493) and among individuals within populations ( Φ PT = 0.619).
    • Correction
    • Source
    • Cite
    • Save
    • Machine Reading By IdeaReader
    0
    References
    0
    Citations
    NaN
    KQI
    []