Evaluation rapide de difference d'abondance d'acides nucleiques, avec un systeme d'oligonucleotides haute densite

L'invention concerne un procede simplifie pour mettre en evidence des differences dans l'abondance d'acides nucleiques (par exemple de niveaux de leur expression) entre deux echantillons ou davantage. Le procede consiste a preparer un systeme contenant un grand nombre (par exemple superieur a 1000) de sondes oligonucleotidiques differentes choisies arbitrairement, ou la sequence et l'emplacement de chaque sonde sont connus. Les echantillons d'acide nucleique (par exemple d'ARNm) de deux echantillons ou davantage sont soumis a une hybridation avec les sondes du systeme et le motif d'hybridation est determine. Les differences dans les motifs d'hybridation entre les echantillons indiquent des differences dans l'expression des differents genes, entre ces echantillons. L'invention concerne egalement un procede pour marquer l'extremite d'un acide nucleique. Dans une forme d'execution, le procede consiste a choisir un acide nucleique et un oligonucleotide marque et ensuite a lier l'oligonucleotide a l'acide nucleique par voie enzymatique. Ainsi, par exemple, quand l'acide nucleique est un ARN, on peut lier l'oligonucleotide marque en utilisant une ARN-ligase. Dans une autre forme d'execution, le marquage terminal peut se faire en choisissant un acide nucleique et des nucleosides triphosphates marques et en liant les nucleosides triphosphates a l'acide nucleique a l'aide d'une transferase terminale