Tuberculose pulmonaire : évaluation des performances de la stratégie diagnostique microbiologique actuelle

Introduction Le diagnostic microbiologique des tuberculoses pulmonaires (TBp), repose toujours, en 2019, sur un algorithme fastidieux laissant peu de place aux outils de biologie moleculaire (BM). L’objectif de cette etude est d’evaluer la performance des principaux tests microbiologiques utilises dans un centre tertiaire a forte incidence de TB et d’etablir un etat des lieux permettant de definir une strategie diagnostique optimale. Materiels et methodes Analyse retrospective mono-centrique des resultats microbiologiques provenant de prelevements bronchopulmonaires des patients avec culture positive a M. tuberculosis complex sur une periode de 3 ans (1er janvier 2015 au 31 decembre 2017) : evaluation des performances diagnostiques du 3e tubage gastrique ou BK-crachat (BKc), de la fibroscopie bronchique (FB), du BKc post-FB, ainsi que de la BM (geneXpert MTB/RIF). Resultats Un total de 307 patients ont eu au moins une culture positive a M. tuberculosis complex a partir de prelevements broncho-pulmonaires, dont 11 diagnostics fortuits au cours d’une FB realisee pour une autre indication. Apres leur exclusion, 296 patients ont ete inclus dans l’etude dont 139 etaient bacilliferes (47 %). Le 3e BKc a permis un diagnostic supplementaire pour 4 % des TB bacilliformes et 11 % des non bacilliformes. Les performances de l’examen direct (ED) n’etaient pas affectees par une strategie realisant le 2e BKc le meme jour que le 1er BKc (fin de matinee) ou le lendemain (au reveil, p = 0,9). De meme, les performances des cultures pour les patients non bacilliferes n’etaient pas significativement differentes selon la strategie (p = 0,3). La mediane de positivite des cultures en milieu liquide etait plus precoce chez les patients bacilliferes (6j [4 ; 8]) que chez les non-bacilliferes (16j [12 ; 20] p  Conclusion Notre serie a permis de mettre en evidence : – un raccourcissement possible du delai entre les prelevements sans impact negatif ; – un prelevement profond (FB) permet une rentabilite diagnostique supplementaire non negligeable pour les patients non bacilliferes (3,4 %) ; – la contribution interessante de la BM sur differents types de prelevements, en ciblant bien les fortes suspicions de TBp pour un meilleur rapport cout-efficacite.