A NMR and MD study of the active site of factor Xa by selective inhibitors

L'etude structurale d'inhibiteurs du facteur Xa, une enzyme de coagulation, obtenus par chimie combinatoire : Ac-Tyr-Ile-Arg-Ile-NH2, Ac-(4-amino-Phe)-(Cyc.-Gly)-NH 2 , a ete realisee par RMN NOE de transfert et modelisation moleculaire. Les structures ont ete calculees sous contraintes RMN : geometrie de distance, recuit simule et minimisation, affinees par une recherche conformationnelle et recuit de l'inhibiteur place dans le site actif et optimisees par simulation de dynamique moleculaire du complexe dans l'eau. L'inhibiteur presente une structure compacte positionnee dans le site d'interaction hors d'acces du site catalytique. Ce modele permet d'expliquer le mode d'action, l'affinite et la specificite des peptides.