Herramienta web para la clasificación de microsatélites polimórficos en genomas bacterianos

Las secuencias repetidas en tandem, especificamente los mini y micro satelites, han demostrado ser muy eficaces en la clasificacion de bacterias patogenicas como B. anthracis, M. tuberculosis y P. aeruginosa, entre otras. En humanos es manifiesta su participacion estando relacionados con mas de ochenta enfermedades, gran parte de ellas de tipo neurodegenerativas, musculares y algunos tipos de cancer. La herramienta web que presentamos es el resultado de la deteccion computacional de estas secuencias en genomas bacterianos completos y su correspondiente anotacion en la estructura genomica de acuerdo a las diferentes regiones donde estos se localizan. La herramienta tiene como fin primario brindar un sistema relacional que permita al investigador ubicar los microsatelites de diferentes especies bacterianas, con mas de un genoma secuenciado para inferir su posible caracter polimorfico, dentro del contexto de la estructura genomica y asi proveer un primer acercamiento al rol putativo que los microsatelites desempenan desde el punto de vista funcional. La herramienta se puede aplicar no solo en estudios taxonomicos y epidemiologicos sino en la deteccion de posibles relaciones de estas secuencias con las funciones moleculares, procesos biologicos y, en ultima instancia, las diversas formas de evolucion de estas especies. El sitio web brinda el servicio de consultas a la base de datos de microsatelites bacterianos de acuerdo al sistema de tablas relacionales y atributos propios de las mismas. Cuenta ademas con los servicios tipicos de un sitio con estas caracteristicas como: sistema de autenticacion, foro, encuestas, enlaces y documentacion sobre la metodologia empleada y del tema en cuestion.(AU) The tandem repeat sequences, especially mini and microsatellites, have proven to be very effective in classification of pathogenic bacteria such as B. anthracis, M. tuberculosis and P. aeruginosa, among others. In human beings it is manifest its participation, being related with over eighty diseases, nearly all neurodegenerative and muscular, and some kinds of cancer. The web tool we are offering here is the result of computational detection of these sequences in whole bacteria genomes, and its respective annotation in the genomic structure according to the different regions where they are localized. The primary goal of this tool is to offer a relational system that allows mapping the microsatellites of bacterial species, all of them with more than one genome sequenced to infer their possible polymorphic character, in the context of genomic structure and thus providing a first approach to the putative role they perform from the functional point of view. The tool can be applied not only in taxonomical and epidemiological studies but in the detection of possible relationships of these sequences with the molecular functions, the biological processes and, as a last resort, the different forms of these species evolution. The web site offers the service of queries to the bacterial microsatellites database according to the related tables and its inherent attributes. It also has the typical services of this kind of site like: logging system, forum, polls, links and documentation about the employed methodology and the topic.(AU)