Étude comparative du transcriptome de cellules épithéliales bronchiques, issues de sujets sains ou mucoviscidosiques, infectées par Pseudomonas aeruginosa

Introduction La colonisation par Pseudomonas aeruginosa des voies aeriennes de patients atteints de mucoviscidose et la reponse inflammatoire chronique qui en resulte conduisent a une deterioration du tissu pulmonaire et par consequence a une perte de la fonction respiratoire responsable de l’evolution pejorative de la maladie. L’epithelium respiratoire qui constitue une barriere physique de defense contre les micro-organismes a aussi la capacite d’etablir une reponse immunitaire innee. Notre etude consiste a comparer le transcriptome de cellules epitheliales bronchiques primaires (CEBP) saines (non-CF) a celui de CEBP de patients atteints de mucoviscidose (CF) au cours d’une infection a P. aeruginosa L’objectif est d’identifier les modifications d’expression de genes de l’immunite innee pouvant expliquer la persistance de P. aeruginosa et de la reponse inflammatoire dans la mucoviscidose. Methodes Des CEBP primaires de 4 sujets non-CF et de 4 patients CF (F508del homozygote) (Epithelix) ont ete infectees par P. aeruginosa (souche PAK) et une cinetique a ete realisee (0, 2, 4 et 6 heures) a une MOI de 0,25. Les ARNm ont ete purifies, analyses pour leur purete et sequences par la technique Illumina RNA-seq. Resultats L’analyse complete du transcriptome montre une expression significativement differente de nombreux genes au cours de l’infection entre les cellules CF et non-CF. Nous avons pu ainsi identifier des differences de modulations d’expression de genes impliques dans la production de cytokines (TNF, IL-17C, IL-32), de chimiokines (CXCL5, CCL5), de peptides anti-microbiens (SLPI, pentraxin 3), de peptidases (granzyme B, metalloproteases, serpines, kallikreines) et de facteurs de transcription (KLF2). Conclusions Cette etude a permis de mettre en evidence des differences d’expression de genes de l’immunite innee au cours de l’infection par P. aeruginosa de cellules CF, pouvant etre a l’origine de la forte reponse inflammatoire ou de la persistance de P. aeruginosa dans la mucoviscidose. Notre objectif est maintenant de confirmer l’expression proteique de ces differentes cibles d’interet et d’identifier les facteurs de virulence bacteriens responsables de ces modulations d’expression.