La sélection génomique des ovins laitiers en France: stratégies, premiers résultats des évaluations génomiques et perspectives

Les programmes de selection ovins laitiers francais evaluent sur descendance environ 700 beliers par an, avec de fortes variations selon les races. Le stockage de sang des beliers d'lA a Labogena depuis le milieu des annees 90 et la disponibilite de la puce «OvineSNP50 ® » d'Illumina depuis 2009 rendent envisageable la selection genomique pour les races ovines laitieres francaises. Les acteurs de la profession se sont organises dans cette perspective, dans le cadre du Comite National Brebis Laitieres, en partenariat avec l'INRA et l'Institut de l'Elevage, regroupes au sein de l'UMT genetique des petits ruminants. En race Lacaune, l'objectif des projets SheepSNPQTL et Roquefort'in est de disposer d'une population de reference d'environ 3000 beliers, et de tester la selection genomique sur 2 cohortes de testage. Pour les races ovines laitieres des Pyrenees, ou les populations raciales de reference sont, a l'exception de la Manech Tete Rousse (MTR), de taille plus reduite, le projet Genomia vise a tester une selection genomique multiraciale associant les races Manech (France) et Latxa (Espagne), grâce au genotypage de 3100 beliers d'lA en 2011 dont pres de 2000 pour les populations francaises. L'etat d'avancement des 2 programmes est presente et resitue dans une strategie globale de selection genomique. L'evaluation genomique a ete realisee selon la methodologie GBLUP, pour l'ensemble des phenotypes disponibles. Nous presentons les resultats de precision des evaluations genomiques realisees, en races Lacaune et MTR, sur la base d'une population d'apprentissage respectivement de 1933 et 1002 beliers genotypes et une population de validation, respectivement de 682 et 293 jeunes beliers. Dans tous les cas, l'evaluation genomique est plus precise que l'evaluation polygenique, les gains relatifs de precision variant de 10 a 41% selon la race et le caractere consideres. Parallelement a ces travaux, les maitres d'oeuvre des schemas de selection s'interrogent sur les evolutions techniques que supposerait la mise en place de schemas de selection genomiques, mais aussi sur les consequences organisationnelles et contractuelles induites.