Identification par exome de 2 biomarqueurs génétiques rares fortement associés à la pelade

Introduction La pelade est une dermatose alopeciante non cicatricielle acquise. C’est une maladie multifactorielle, associant des mecanismes auto-immunes et une predisposition genetique. Sa prevalence est estimee a 0,1–0,2 %. Une composante genetique forte est remarquable du fait de la frequence des formes familiales (20 %). Cette maladie, par son caractere affichant, a un retentissement psychologique important sur la qualite de vie du patient. Le but de cette etude etait d’identifier de nouveaux genes de susceptibilite a la pelade. Materiel et methodes Une etude d’exome (Kit Agilent R All Exon V5, sequenceur Hi Seq 1000 Illumina) a ete effectuee chez 12 patients (2 familles avec deux membres atteints et 8 patients porteurs de pelades severes sporadiques). Apres analyse biostatistique des variants, nous avons selectionne une dizaine de SNPs rares (frequence allelique  Resultats L’analyse des exomes permettait notamment d’identifier une mutation d’epissage, situee dans l’exon 22 du gene SEC31A c.2968 + 1G > T (rs78735860), et une mutation faux sens dans l’exon 4 du gene MPZL3  c.463A > G (rs17121966), presente chacune chez 3 individus non apparentes. De plus, ces 2 mutations segregaient dans une famille. Ces deux mutations ont ete par la suite genotypees par sequencage Sanger chez les malades et les temoins. La comparaison de la frequence de ces variants chez les patients et les temoins suggere une forte association au risque de pelade : SEC31A (rs78735860)  : p value MPZL3), p value  = 0,003, OR 9,52 (1,74–68,30). Discussion Le gene SEC31A est localise sur le chromosome 4q21.22, code pour une proteine de 1221 AAs d’expression ubiquitaire. SEC31A joue un role important dans le systeme immunitaire via la presentation de l’antigene du peptide exogene par le CMH de classe I. Le gene MPZL3  est localise sur le chromosome 11q23.3, et code pour une proteine de 236 AAs. MPZL3  joue un role majeur comme regulateur de la differenciation de l’epiderme. Chez la souris, un role complexe du gene MPZL3  a ete demontre dans le controle du developpement de la peau et de la croissance des cheveux. Ces 2 genes pourraient donc avoir un role important dans la physiopathologie de la pelade via soit le systeme immunitaire soit probablement dans le cycle pilaire. Conclusion Nos resultats montrent que certaines mutations de SEC31A et MPZL3  predisposent fortement a la pelade. Le sequencage de l’ensemble de la sequence codante de ces genes est en cours afin d’identifier potentiellement d’autres variants deleteres.