Genetic characterization of a Tamarix spp. germplasm collection in Italy

2014 
Tamarix L. plants are tolerant to extreme environmental conditions and represent a resource for the recovery of marginal areas. The aim of this study is to develop a molecular method for species assignment and to characterize the genetic differentiation of Italian Tamarix populations. Blind sampling was performed and individuals were gathered without any regard for species identity from seven sites in Italy. If possible, flowers for species identification were collected, but 60% of samples remained unidentified. The genotypic profile of 17 microsatellite markers and a Bayesian statistical approach allowed the individuals to split among genetic entities rather than by their species identity. A clear assignment of Tamarix africana Poir. individuals was found, but this was not the case for Tamarix gallica L. and Tamarix canariensis Willd., whose individuals were clustered in a unique group (T. gallica-like). In T. africana, the Bayesian analysis of the genetic structure pointed out the existence of a unique gene pool, whereas according to principal coordinates analysis (PCOA) and FST values, the populations from Lazio and Sardinia were more differentiated. All the analyses performed showed a differentiation between Sicily and peninsular Southern Italy in the T. gallica-like group. This study is the first to report the characterization of the natural genetic resources of Italian tamarisks and it suggests the absence of genetic differentiation between T. gallica and T. canariensis. Resume : Les plantes de Tamarix L. sont tolerants ades conditions environnementales extremes et representent une ressource pour la restauration des zones marginales. Le but de cette etude etait de developper une methode moleculaire permettant d'assigner un individu aune espece et de caracteriser la differenciation genetique des populations de Tamarix en Italie. Un echantillonnage au hasard a ete realise et des individus ont ete recoltes apartir de sept sites en Italie, peu importe l'identite des especes. Lorsque cela etait possible, les fleurs permettant d'identifier l'espece ont ete recueillies, mais 60 % des echantillons demeuraient non identifies. Le profil genotypique de 17 marqueurs microsatellites et une approche statistique bayesienne ont permis de separer les individus en entites genetiques plutot que par leur identite en tant qu'espece. Une assignation claire des individus appartenant aTamarix africana Poir. a ete trouvee, contrairement aTamarix gallica L. et Tamarix canariensis Willd., dont les individus s'agregeaient en un seul groupe (apparente aT. gallica). Chez T. africana, l'analyse bayesienne de la structure genetique a souligne l'existence d'un pool genetique unique, alors que selon des valeurs de PCOA et de FST, les populations de Lazio et de Sardaigne etaient davantage differenciees. Toutes les analyses realisees ont montre une differenciation du groupe apparente aT. gallica entre la Sicile et la peninsule de l'Italie du Sud. Cette etude est la premiere arapporter la caracterisation de ressources genetiques naturelles du tamaris italien, et elle suggere une absence de differenciation genetique entre T. gallica et T. canariensis. (Traduit par la Redaction)
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