鸡miR-1816前体区单核苷酸多态性(SNP)与鸡经济性状关联分析

MicroRNAs（miRNAs）前体区的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）,可能会影响miRNA的加工过程,导致成熟miRNA产量的改变,进而发挥重要的生物学功能。为研究位于miR-1816前体区圆环上的单个SNPrs16057773（A〉G）的遗传效应,并探究该SNP是否影响成熟miR-1816的生成,在固始鸡-安卡鸡（Gallus）F2资源群中,对该SNP与经济性状进行关联分析,该SNP与不同周龄的体重及部分体尺性状包括胫围、体斜长和骨盆宽等性状存在显著相关（P〈0.05）,表明该SNP在鸡生长发育过程中扮演重要角色。使用在线软件预测显示,该SNP不影响miRNA二级结构的稳定性。通过进一步构建miR-1816的2种基因型的pcDNA3.1-EGFP表达载体并转染鸡胚成纤维细胞DF1,实时荧光定量PCR（quantitative Real-time PCR,q RT-PCR）检测显示,不同基因型重组质粒组间成熟miR-1816的表达量相似,表明该SNP不影响miR-1816的加工过程。本研究揭示了位于miR-1816基因前体区上的SNP与鸡的经济性状存在显著的相关性,但该SNP并不影响miR-1816的加工过程,不改变成熟miR-1816的表达水平,说明该SNP不是通过调控自身miRNA的表达量而发挥重要的功能。该研究提示miRNA前体区SNP发挥功能存在不同的途径,有助于对miRNA精细加工过程的理解。