Optimisation de l’identification et du dénombrement du microphytoplancton avec le système couplé de numérisation et d’analyse d’images FlowCAM – Zoo/PhytoImage (système innovant). Action 9 – Livrable 3. Evolution du matériel de numérisation : prototype FastCAM et perspectives. Rapport final, février 2016

Ce livrable contient l’ensemble des travaux de developpement du FastCAM, nouvel outil de numerisation rapide du phytoplancton, ayant eu lieu en 2015. Il est constitue de deux documents : Un rapport de presentation du FastCAM et de sa comparaison avec le FlowCAM. Le FlowCAM permet la numerisation d’un echantillon de phytoplancton avec des grandissements X10 et X4. Le premier permet une meilleure description morphologique et donc une meilleure resolution taxonomique mais avec un temps d'acquisition environ 16X plus long. Ainsi, pour des analyses en routine, seule une numerisation au X4 est possible. Un gain considerable serait de pouvoir realiser une acquisition au grandissement 10X avec un temps d'analyse plus court, comparable au 4X. Un systeme d’imagerie rapide en flux a donc ete developpe en ce sens. Il a ete nomme FastCAM. Le systeme repose sur l’utilisation d’une camera rapide haute resolution (2 Megapixels) permettant l’acquisition a 340 images/s. Grâce a cela, il permet de numeriser 10 mL d’echantillon avec un grandissement X10 en moins de 15 min. La comparaison des images a celles obtenues avec le FlowCAM en un temps equivalent au X4 montre clairement un gain a l’utilisation du FastCAM. Les perspectives maintenant sont la constitution d’un set d’apprentissage pour un couplage avec le logiciel Zoo/Phytoimage. Un diaporama de presentation du systeme, presente lors d’une reunion de projet (4 novembre 2015)