Automatický doking ligandu do tunelu v proteinu

V teto diplomove praci se věnujeme popisu vybraných casti noveho algoritmu pro analýzu a výpocet spojite trajektorie ligandu skrze tunel v biomolekule, který vede z jejiho povrchu k aktivnimu mistu. Konkretně rozebereme algoritmus pro diskretizaci tunelu a uvedeme výsledky vyhodnoceni nad sirokou skalou tunelů. Druhou cast prace tvoři popis techniky zlepsujici energetický profil trajektorie ligandu pro tunely s vice uzkými hrdly.