Aplicación de la probabilidad y la entropía a la proteína EBA-140. Caracterización matemática de péptidos de alta unión

2009 
Resumen Una de las proteinas del merozoito de Plasmodium falciparum, la EBA-140, tambien conocida como BAEBL o PfEBP-2, comparte caracteristicas estructurales y homologia con EBA-175 y EBA-181. Estudios de la localizacion sub-celular sugieren que esta localizada en los micronemas. Por medio de la construccion de un espacio de probabilidad, donde se cuantifico la posibilidad de aparicion por posicion para los 20 aminoacidos en peptidos con tamano de 20 residuos para 6 secuencias de alta union de la proteina EBA-140, se calculo la probabilidad, sumatoria de probabilidad y Entropia para las 61 secuencias de 20 residuos de la proteina EBA-140, para posteriormente caracterizar matematicamente los peptidos de alta union y los que no lo son. Adicionalmente se realizaron las mismas medidas para peptidos teoricos analogos, donde se cambiaron por Glicinas aminoacidos comprobados experimentalmente como criticos, y se efectuaron los calculos. Los valores de probabilidad, Sumatoria de Probabilidad y Entropia para las secuencias comprobadas experimentalmente de alta union varian entre los rangos asociados al macroestado union, mientras que todos estos mismos valores para los peptidos comprobados de baja union se encuentran fuera de los rangos asociados al macroestado de union. Los valores de probabilidad, sumatoria de probabilidad y Entropia diferencian los peptidos de alta union de los de baja union, acertando en el 100% de los casos estudiados, segun estudios experimentales. El fenomeno de union de la proteina estudiada presenta un orden subyacente, que es caracterizable a partir de las leyes de la probabilidad y de la Entropia de forma objetiva y reproducible.
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