Etude de la conformation de l'ARNt initiateur et de l'ARN ribosomique 16S d'Escherichia coli lors de l'initiation de la biosynthese des proteines : relations structure-fonction

Nous nous sommes interesses a l'etude de la structure fine de l'arnt initiateur et de l'arn 16s de la sous-unite ribosomique 30s pendant les differentes etapes qui ponctuent la fixation de l'arnt initiateur sur la sous-unite ribosomique 30s, dans le systeme procaryotique qui sert de reference, escherichia coli. En ce qui concerne le trna, sa conformation globale est similaire a celle de l'arnphe de levure. L'aminoacylation et la formylation induisent des changements conformationnels discrets dans l'arnt. En presence de if2, des protections dans la region t et le bras accepteur de l'arn ont ete observees. Dans le complexe 30s/aug/if2/gtp/arnt, c'est l'extremite du bras accepteur et l'anticodon qui sont en contact avec la sous-unite 30s et/ou le triplet aug. Les resultats de pontage entre if2 et l'arnt sont en bon accord avec ces experiences de footprint. En ce qui concerne l'arn 16s, la fixation de if2 induit des ajustements conformationnels dans l'arn mais aucun contact direct entre l'arn 16s et if2 n'a ete observe. La fixation supplementaire de l'arnt et de l'aug entraine un nouveau changement conformationnel de l'arn 16s. Ces donnees de pontage if2/arn suggerent que if2 se fixerait sur la face exterieur du 30s et proche de la protuberance laterale de la sous-unite 50s