Caractérisation des isolats de Phytophthora spp du verger cacaoyers de Côte d’Ivoire

Objectifs : La pourriture brune des cabosses due a Phytophthora spp. est l’affection la plus repandue et la plus importante dans la cacaoculture ivoirienne. Cette etude a ete realisee pour caracteriser et identifier les isolats de Phytophthora spp a partir des caracteres morphologiques et moleculaires. Methodologie et resultats : Cinquante isolats provenant des principales zones (Est, Centre-Ouest, et Sudouest) du verger cacaoyers de la Cote d’ivoire ont ete isoles a partir de cabosses immatures atteintes de pourriture brune. Les caracteres phenotypiques asexues et moleculaires a savoir : la longueur, la largeur, le rapport longueur/largeur des sporocystes, la longueur du pedicelle, la forme et la caducite des sporocystes, le type de colonie et l’analyse des fragments de restriction de l’ADN des regions ITS (Espaceur Interne Transcrit) ont ete evalues. Les sporocystes des isolats etudies apparaissaient tres variables dans leur forme d’un isolat a un autre. Ils etaient de forme ovoide, ellipsoide, obpyriforme, ovoide-obpyriforme et arrondis a leur base. Les sporanges des isolats observes etaient caducs donc eparpilles avec un pedicelle court (2,92 ± 1,18 Gm). Les sporanges etaient egalement variables par leur taille, variant entre 33,25 a 55,00 Gm en longueur et entre 21,99 a 34,37 Gm en largeur avec un rapport longueur/largeur variant de 1,23 a 1,94. Les colonies sur culture carotte-agar brut etaient radiees, stries et/ou stellees, et petaloides. L’amplification par ITS-PCR de l’ADN a genere un fragment specifique de 900 bp. L’analyse des fragments de restriction obtenus apres digestion par les endonucleases (AluI ; PvuII ; HaeIII ;HinfI et MspI) a montre que tous les isolats etudies appartenaient a l’espece Phytophthora palmivora. Conclusion et application de resultats : Il ressort de notre etude que la technique PCR-RFLP a ete plus discriminante par rapport aux methodes traditionnelles pour caracteriser et identifier les isolats de Phytophthora spp. Les resultats montrent egalement que la technique PCR-RFLP est un moyen rapide selectif et fiable dans l’identification des Phytophthora spp. En outre, cette methode peut etre utilisee comme outil de prevention et de gestion dans la lutte contre la pourriture brune des cabosses. Cette etude a confirme la presence de Phytophthora palmivora comme l’espece la plus predominante bien que Phytophthora megakarya ait ete recemment decouverte dans l’Est du verger cacaoyers. Mots cles : pourriture brune ; sporange ; pedicelle ; papille ; Phytophthora spp ; region ITS ; PCR-RFLP