绵羊 PDGF-D 基因多态性与尾型的关联

旨在研究血小板源性生长因子-D（platelet-derived growth factor-D，PDGF-D）与绵羊尾型的关系，寻找可用的分子标记，同时对前期的研究结果进行验证。本研究在533只绵羊（湖羊、藏羊、杜泊×湖羊杂交羊）试验群体中，选取藏羊、湖羊两个品种各30个个体的血液样本，等量混合分别构建两个DNA混池，对PDGF-D基因的外显子及其上下游1 000 bp扩增，目的片段测序分析后，采用飞行质谱方法对检测到的SNP位点进行基因分型，Haploview4.1软件对突变位点进行连锁不平衡分析，使用SPSS19.0软件对PDGF-D基因SNP位点与尾型性状进行关联分析。结果显示，在PDGF-D基因及其上下游1 000 bp共找到6个突变位点，其中rs5、rs27、rs28与尾长、尾宽及尾周长均相关，rs6、rs19仅与尾长相关，rs13与尾宽、尾周长均显著相关（P < 0.05）。连锁不平衡分析结果表明，rs6~rs13之间存在强连锁；组合基因型与尾型关联分析结果显示，CCGG型个体无论是在尾长、尾宽还是在尾周长上，其平均值均显著（P < 0.05）或者极显著（P < 0.01）低于其他组合基因型，但在群体中的数量较少。结果表明，PDGF-D基因对绵羊的尾型有着较为显著的影响，其SNP位点作为分子标记对于绵羊尾型选育工作有着一定的指导意义，可考虑将CCGG型作为筛选小尾绵羊的潜在分子标记，但是该基因型个体在群体中所占的比重较小，可适当增强人工选育以扩大数目。