Análise de transcritoma e expressão gênica de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) submetido ao estresse abiótico

O feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) e um genero alimenticio de primeira necessidade fortemente associado a seguranca alimentar mundial. Dos fatores que afetam a sua producao, episodios de estresses abioticos, como a seca, figuram como de grande risco e impacto, podendo restringir as areas de cultivo e o rendimento das lavouras. A caracterizacao em larga escala da expressao diferencial de genes envolvidos na resposta da planta aos estresses abioticos possibilita tracar o perfil dos genes, bem como das rotas metabolicas, envolvidos nos mecanismos de tolerância aos estresses abioticos. Nesse estudo, a expressao de genes relacionados a resposta aos estresses abioticos em tecido foliar e radicular de dois genotipos de feijoeiro comum contrastantes quanto a tolerância ao estresse de seca foi avaliada pela analise de RNA-Seq. Um novo transcritoma de feijoeiro comum foi construido apresentando 1668 novos loci e 23 169 novas isoformas. Ao todo foram identificados 54 807 transcritos distribuidos em 28 640 genes. A analise de expressao diferencial em tecido foliar e radicular foi realizada atraves do pacote edgeR, Bioconductor, possibilitando identificar 1242 genes diferencialmente expressos (GDE). Destes, 458 genes tiveram expressao diferenciada no genotipo tolerante (191 induzidos e 267 reprimidos) quando comparado ao genotipo sensivel. A anotacao funcional revelou no genotipo tolerante um predominio de genes nas categorias enriquecidas oxidoreductase activity, oxidation-reduction process, regulation of gene expression, regulation of macromolecule metabolic process e dioxygenase activity. Por meio da tecnica de qPCR, dos 15 GDEs selecionados para caracterizacao, 74,42% foram validados quanto a expressao diferencial. Adicionalmente, um total de 151 283 variantes foram identificadas, sendo 135 167 SNPs e 16 115 Indels. A anotacao e predicao de efeitos das variantes foi realizada com SnpEff v.4.2, onde foram identificados 330 378 efeitos putativos para as variantes encontradas. Os dados utilizados nesse estudo serao disponibilizados no Sequence Read Archive (NCBI). Os resultados deste estudo contribuem para a ampliacao do conhecimento sobre os mecanismos genicos, bem como das variantes funcionais, relacionados com a tolerância a estresses abioticos em feijoeiro comum.