Plasticité et diversité chromatique de l'huitre perlière PINCTADA MARGARITIFERA var.cumingii (linnaeus, 1789) : analyse du trytique "phénome, génome, épigénome"

L'huitre perliere, Pinctada margaritifera var. cumingii (Linnaeus, 1758), constitue la seconde ressource economique de la Polynesie Francaise. C'est l’un des seuls bivalves exprimant une gamme aussi variee de coloration internes de coquille, et par correlation, de couleur de perle. Cette variabilite phenotypique est en partie sous controle genetique, mais est egalement sous influence environnementale. Dans ce contexte, cette these s’interesse a identifier pour trois phenotypes d’interet pour le secteur perlicole (rouge, jaune et vert) : i) une methode permettant de caracteriser ces variations chromatiques, ii) les genes cles exprimes lors de la formation de coquilles menant a des phenotypes de couleurs contrastes ; iii) les variants genetiques responsables de l'expression de ces couleurs ; iv) des mecanismes epigenetiques controlant la plasticite chromatique en reponse a l'environnement. Ces resultats ont permis de deceler une batterie de marqueurs genomiques et epigenomiques qui permettra de poser les bases vers la selection genomique d’individus fortement colores. Ces informations couplees aux futurs resultats d’etudes genomiques sur les autres caracteres d’interet perlicole vont permettre d’obtenir des populations de references selectionnes par marqueurs genomiques pour la production de lignees elites d’huitres perlieres donneuses de greffons de haute qualite. Outre l'importance de ces resultats pour la perliculture, cette these ameliore nos connaissances sur les processus de pigmentation des mollusques et pourrait favoriser l'emergence d'un nouveau modele pour l'etude pluridisciplinaire de la pigmentation.