Segmentação de Árvore de Componentes por Valores de Extinção: Aplicação na Detecção Automática de Núcleos Celulares

2021 
Objetivo: Este trabalho propoe um algoritmo nao parametrico para a segmentacao da arvore de componentes por valores de extincao. Esta abordagem se mostrou adaptada para a caracterizacao de nucleos celulares, importante na mensuracao e compreensao de processos biologicos. Metodos: O metodo consiste na rotulacao de maximos regionais com valores de extincao estaticamente relevantes e particionamento da arvore de componentes, dado o caminho de influencia de cada rotulo. Esta ideia foi validada na identificacao de nucleos celulares, em um dataset de 664 imagens, com ground truth das segmentacoes. Resultados: A correlacao da contagem de nucleos foi de 0,95 (p < 0,05). As imagens binarias foram geradas com acuracia de 0,92±0,08, sensitividade de 0,62±0,19, especificidade de 0,99±0,02 e IoU de 0,57±0,16. Conclusao: Apesar da simplicidade de nao exigir parâmetros ou ser treinado, o metodo e robusto para separar regioes de interesse relativamente mais brilhantes em imagens, como no caso dos nucleos celulares.
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