Escherichia coli : sensibilité aux β-lactamines et diversité génomique des souches isolées en Franche-Comté

Resume Objectifs – Preciser l'incidence des colonisations/infections a E. coli dans les etablissements de soins de Franche-Comte en 1999 et actualiser les donnees concernant sa sensibilite aux antibiotiques. Confirmer le caractere polyclonal des souches cliniques de E. coli . Materiel et methodes – Les souches cliniques de E. coli ( n =199) ont ete caracterisees par determination de leur phenotype de resistance. Nous avons compare differentes techniques (diffusion et E-test) pour preciser la frequence de resistance a l'association amoxicilline-acide clavulanique. La determination des pulsotypes a permis d'evaluer la diversite clonale au sein de l'espece. Resultats – Les incidences des patients colonises/infectes etaient de 4,63 pour 100 admissions et de 7,21 pour 1 000 jours d'hospitalisation. Le taux d'incidence hebdomadaire des colonisations/infections a E. coli pour 100 lits dans les unites de court sejour s'echelonnaient de 3,3 a 11,5 % en fonction du type d'unite. Les prelevements d'origine urinaire etaient les plus nombreux (64,5 %). Les frequences de resistance (I + R) aux β -lactamines etaient respectivement de 36,7 % pour l'amoxicilline, 27,1 % pour l'association amoxicilline-acide clavulanique, 35,7 % pour la ticarcilline et 2,5 % pour la ceftazidime. La determination de la CMI par E-test de l'association amoxicilline-acide clavulanique montrait que la proportion de souches resistantes (CMI >16 mg/L) ne depassait pas 5,0 %. De plus les valeurs de CMI des souches resistantes sont relativement faibles (24 a 48 mg/L). Le dendrogramme construit d'apres les pourcentages de similitude des profils de macrorestriction de l'ADN avait un aspect « en brosse » caracteristique d'une grande diversite clonale. Conclusion – Chez E. coli , la production de penicillinase est le mecanisme principal de resistance a l'amoxicilline, la resistance a l'association amoxicilline-acide clavulanique ne devrait avoir qu'un impact therapeutique limite. En effet la plupart des souches de sensibilite diminuee sont classees comme intermediaires et les souches resistantes ont des CMI peu elevees. Le caractere polyclonal des souches confirme que la diffusion de la resistance aux β -lactamines chez E. coli n'est pas liee a la diffusion clonale de souches resistantes.