Identification de QTL pour le rendement, les caractéristiques des fèves et la résistance à Phytophthora Palmivora chez Theobroma Cacao L.

Cette etude visait a cartographier les QTL qui controlent les caracteristiques de rendement des feves et la resistance a Phytophthora palmivora dans trois descendances en segregation : une issue de croisements (SCA6 x. H) x Cl, deux descendances pleins-freres issus de (P7 x ICS100) et (PY x. ICS95) x Cl. Des plants âges d'environ ID ans ont fait l'objet d'un suivi individuel pendant trois periodes de recolte par rapport a la pourriture brune des cabosses de Phytophthora (PPR), pour les caracteristiques liees au rendement et aux feves. La resistance a Phytophthora des descendances pleins-freres a aussi ete evaluee par essai sur disques de feuilles. Des cartes genetiques, basees uniquement sur les marqueurs SSR, ont ete construites avec 127, 128 et 179 individus, respectivement. Quatorze et sept QTL pour les caracteristiques de rendement ont ete detectes sur les parents (P7 x ICS100) et (P7 x ICS95) respectivement. Les chromosomes 4 et 10 sont les chromosomes ancres pour les QTL de rendement entre les parents. Vingt-sept et dix-huit QTL pour les caracteristiques des feves ont ete cartographies chez les parents (P7 x ICS100) et (P7 x ICS95) respectivement. Le chromosome 4 portait le nombre le plus eleve de QTL de differentes caracteristiques de feves. Globalement, les QTL de caracteristiques de rendement et de feves sont colocalises. Les QTL etaient plus stables au fil des ans, en particulier pendant la periode de recolte principale. Pour le PPR., 3, 2 et 3 QTL ont ete identifies respectivement pour les parents (P7 x H), (P7 x ICS95) et (SCA6 x ICS95). Trois QTL de resistance foliaire ont ete identifies sur les chromosomes 1, 2 et 10 des parents (P7 x ICS100). Un QTL PPR chez le parent " SCA6 x H " et un QTL de resistance foliaire chez le parent " P7 x ICS100 >> ont ete detectes sur le chromosome 1. Certains QTL d'une caracteristique (resistance, rendement, feves) ont ete trouves sur plusieurs chromosomes d'un ou plusieurs parents. En regroupant les parents (SCA6 x H) et (P7 x ICS100), une region de QTL PPR a ete identifiee sur le chromosome 6. Par ailleurs, certains des QTL des caracteristiques etudiees etaient situes dans les memes regions chromosomiques que ceux qui avaient ete identifies dans les etudes precedentes. Certains autres ont ete detectes pour la premiere fois dans l'etude actuelle. Certains QTL ont ete detectes dans les deux familles, alors que d'autres etaient uniquement presents dans une famille. Nos resultats montrent que la selection de genotypes pour la production cacaoyere peut se faire sur la base des informations sur les feves. Les marqueurs associes aux QTL identifies sur des chromosomes particuliers, le chromosome 4 par exemple, sont les meilleurs candidats pour le developpement d'outils de selection. Par consequent, une plus grande attention doit etre accordee a ces chromosomes pour des etudes plus approfondies, associant des genotypes de differents materiels genetiques. (Texte integral)