中国HIV-1 B＇亚型毒株nef基因多态性及其对疾病进展影响的研究

目的 研究我国北方地区B＇亚型HIV-1感染者病毒基因组中nef基因多态性、重要功能区的保守程度,探索其与疾病进展的关系.方法 HIV-1 B＇亚型感染长期不进展者（LTNP）30例,典型进展者（TP）42例,从全血标本中提取全前病毒DNA,经nested-PCR扩增nef基因全长,扩增产物纯化后直接测序,对测得的序列进行系统进化和氨基酸变异分析,并计算比较LTNP组与TP的HIV/AIDS组氨基酸突变位置和频率的差异.结果 nef氨基酸序列长度可变区R21K/E/H/I/Q取代,TP组突变频率（59.52%）低于LTNP组（93.33%,P〈0.005,OR=0.11）.功能区外S15R/K/N取代,TP组突变频率（64.29%）高于LTNP组（33.33%,P〈0.01,OR=3.60）;K39R/E/N取代,TP组突变频率高于LTNP组（P〈0.005）.其他功能区内有少数序列发生变异,但在两组间无差异.结论 未发现中国北方地区HIV-1 B＇亚型nef基因与疾病长期不进展相关联的明显缺失或缺陷,但nef基因序列长度可变区R21位K/E/H/I/Q取代R可能与疾病缓慢进展有关,S15R/K/N取代、K39R/E/N取代可能与疾病进展相关.nfe氨基酸序列的重要功能区较为保守.