Amplification par PCR des gènes nirk et nirs pour la détection rapide des bactéries dénitrifiantes dans l'eau de mer

La denitrification est un processus respiratoire au cours du quel les microorganismes sont capables de substituer a l'oxygene des formes oxydees de l'azote comme accepteur terminal d'electrons dans leur chaine respiratoire. 6 echantillons d'eaux de mer, de bloom algale et de sediment marin ont ete analyses. L'isolement des souches bacteriennes a ete fait apres culture des echantillons dans un milieu riche en nitrate. La recherche des souches potentiellement denitrifiantes a ete effectue suite a l'amplification par PCR des genes responsables de la synthese de la nitrite reductase (nirK et nirS). Les resultats ont montres la presence de 8 souches cultivables. L'amplification par PCR des genes nirK et nirS responsables de la synthese de la nitrite reductase a revelee la presence d'une souche nirK positives et d'une souche nirS positive. L'identification de ces germes par des galeries Api a montre qu'il s'agit de Shewanella putrefaciens et Micrococcus spp.