ESTUDO DE ASSOCIAÇÃO GENÔMICA AMPLA PARA INTERAÇÃO de C. arabica e Pseudomonas syringae pv. garcae

O objetivo deste trabalho foi explorar os recursos geneticos de genotipos de C. arabica do centro de origem para identificar regioes genomicas associadas a resistencia a mancha aureolada. Para isto, 101 genotipos de C. arabica da colecao da Etiopia FAO e 11 cultivares foram sequenciados e genotipados atraves da tecnica de genotipagem por sequenciamento (GBS). O GBS resultou em 6.210.920 tags que foram alinhadas ao genoma de C. arabica e resultou na identificacao de 10.650 SNPs ( Single Nucleotide Polymorphism ). O mesmo material vegetal tambem foi avaliado fenotipicamente para resistencia a mancha aureolada, causada pela Pseudomonas syringae pv. garcae . A fenotipagem varia entre altamente imune a altamente suscetivel. Com esses dados, utilizando o programa FASTmrEMMA foi feito um Estudo de Associacao Genomica Ampla. Como resultado, 5 SNPs, com alto potencial para Selecao Assistida, foram associados a resistencia a mancha aureolada. Alem disso, foi possivel identificar genes proximos aos SNPs relacionados ao mecanismo de defesa das plantas. Entre esses estao genes que codificam as proteinas serina/treonina quinase e a CC-NB-LRR.