نخستین بررسی ویروئید پوست پینهای سیب در میزبانهای سیب و گلابی در ایران و تعیین میزان تنوع ژنتیکی جدایههای ایرانی
2015
ویروئید پوست پینهای سیب، ASSVd(Apple scar skin viroid)، یکی از مخربترین بیماریهای ویروئیدی در میان درختان میوه دانهدار بوده و میتواند خسارات اقتصادی چشمگیری ایجاد نماید. علایم این بیماری شامل شکاف خوردگی، بدشکلی و خالدار شدن میوه در باغات سیب و گلابی در استان خراسان رضوی مشاهده گردید. نمونهبرداری از باغات سیب و گلابی صورت گرفته و RNA از برگهای درختان با استفاده از روش به دام اندازی سلیکا (Silica capture method) استخراج گردید. ASSVd پس از انجام آزمون RT-PCR در نمونههای حاصل از این باغات شناسایی شد. محصول PCR خالص گردیده و با استفاده از ناقلpGEM®-T Easy همسانهسازی شده و پلاسمید نوترکیب حاصل توالی یابی شد. پس از انجام آنالیزهای لازم، 12 جدایه جدید این ویروئید از میزبانهای سیب و گلابی در بانک ژن (NCBI) ثبت گردید. این جدایهها طولی بین 334 -329 نوکلئوتید داشتند. آنالیز فیلوژنتیکی با استفاده از روش neighbor joining نشان داد که جدایههای ایرانی از سایر جدایههای این ویروئید مشخص بوده و در گروه جداگانهای قرار گرفتند. تنوع ژنتیکی از طریق نشان دادن جایگاههای جهش جدایههای ایرانی بر روی ساختار ثانویه مولکول مرجع ASSVd مورد بررسی قرار گرفت. این مطالعه اولین گزارش از شناسایی و بررسی صفات ویروئید پوست پینهای سیب در ایران میباشد.
- Correction
- Source
- Cite
- Save
- Machine Reading By IdeaReader
0
References
0
Citations
NaN
KQI