Method of preparing a sample of fecal microbiota

La presente invention se rapporte a un procede de preparation d'un echantillon de microbiote fecal d'un sujet donneur, comprenant les etapes suivantes: a) le prelevement d'au moins un echantillon de microbiote fecal du sujet donneur, b) dans un delai inferieur a 5 minutes suivant le prelevement, le placement dudit echantillon obtenu en a) dans un dispositif de collecte etanche a l'oxygene, c) le melange de l'echantillon obtenu en b) avec au moins une solution aqueuse saline comprenant au moins un cryoprotectant et/ou un agent de charge, d) optionnellement, la filtration du melange obtenu en c), notamment par un filtre comprenant des pores de diametre inferieur ou egal a 0.7 mm, de preference inferieur ou egal a 0.5 mm, et e) le stockage du melange obtenu en c) ou d) par congelation a une temperature comprise entre -15°C et -100°C, les etapes b) a e) etant realisees en anaerobiose.