牦牛 CSRP3 基因的克隆及组织表达分析

CSRP3基因(Cysteine and glycine-rich protein 3, CSRP3)编码CRP3蛋白, 是一个肌发生的正调节因子, 可通过多种方式在肌肉发育和肌肉细胞结构维持中起重要作用。通过对牦牛CSRP3基因进行克隆及组织表达谱分析, 为后续提高牦牛肉品质的研究提供基础数据。采用RT-PCR方法克隆牦牛CSRP3基因CDS区; 再对其进行序列分析及蛋白结构和功能预测等生物信息学分析; 最后利用实时荧光定量PCR技术检测该基因在牦牛不同组织中的表达量。牦牛CSRP3基因CDS区长585 bp, 编码194个氨基酸; CSRP3基因的系统进化树结果显示, 牦牛与黄牛的亲缘性最近, 其次是绵羊。牦牛CSRP3基因编码的蛋白为偏碱性不稳定亲水蛋白, 无跨膜结构和信号肽, 为非分泌蛋白, 含有磷酸化位点22个, N-糖基化位点2个, O-糖基化位点7个; 存在两个LIM结构域, 属于LIM结构域蛋白质超家族成员, 主要分布于细胞核中; 二级结构以无规卷曲为主, 三级结构的最佳模型为1b8t.1.A; 实时荧光定量PCR结果显示, 牦牛CSRP3基因在臀大肌中有较高表达量。生物信息学分析结果显示, CRP3蛋白含有两个LIM结构域, 主要分布在细胞核中, 实时荧光定量PCR结果显示牦牛CSRP3基因在臀大肌中具有较高表达量, 为牦牛CSRP3基因在牦牛肉品质方面的调控机制研究提供了基础数据。