火龙果 HuICE1 基因的克隆与表达分析

2020 
本研究以‘金都一号’红心火龙果 ( Hylocereus undatus ) 为实验材料,利用 ICE 序列 3' 端的高度保守结构域 (bHLH) ,采用同源克隆法从火龙果果肉中分离得到一条 HuICE1 序列,其 cDNA 序列全长 1 673 bp ,具有一个 1 596 bp 的完整开放阅读框,生物信息学分析显示该基因编码的蛋白定位于细胞核,为水溶性蛋白。蛋白结构预测发现, HuICE1 蛋白属 MYC2 型转录因子,在 3' 端第 340~384 个氨基酸含有高度保守的 bHLH 结构域,表明 HuICE1 基因属 bHLH 家族,还有核定位信号 (NLS) 区、富 S 区、转膜区、类泛素化 (SUMO) 结合位点各 1 个。同源性分析表明,火龙果与甜菜 ( Beta vulgaris ) 的核苷酸序列相似度最高,为 85.10% 。 qRT-PCR 表达分析表明,在火龙果各个组织中 HuICE1 均有表达,说明该基因是组成型表达,此研究为后续研究火龙果抗逆机制提供理论依据。
    • Correction
    • Source
    • Cite
    • Save
    • Machine Reading By IdeaReader
    0
    References
    0
    Citations
    NaN
    KQI
    []