Analýza mikroRNA u extramedulárního relapsu mnohočetného myelomu

Východiska a cile: Mnohocetný myelom (MM) je druhe nejcastějsi hematoonkologicke onemocněni. Zavedeni nových leků do klinicke praxe vedlo k výraznemu zlepseni přeživani pacientů s MM. I přes tato opatřeni je přeživani pacientů negativně ovlivněno tzv. extramedularnim relapsem (EM). EM je způsoben ztratou zavislosti plazmatických buněk na mikroprostředi kostni dřeně a jejich migraci do měkkých tkani. Podstata a přicina tohoto procesu nejsou doposud objasněny. MikroRNA (miRNA) jsou kratke, nekodujici molekuly RNA, ktere jsou zapojeny do mnoha fyziologických, ale i patologických procesů. V ramci několika studii byl prokazan význam těchto molekul i u patogeneze MM. Předpokladame, že se miRNA podileji rovněž na rozvoji EM. Cilem nasi prace bylo analyzovat rozdilne exprese miRNA mezi skupinou MM pacientů a EM pacientů. Material a metody : Pomoci sekvenovani nove generace (NGS) bylo analyzovano 39 vzorků plazmatických buněk z kostni dřeně pacientů s MM při diagnoze a 9 vzorků plazmatických buněk z kostni dřeně nemocných s EM. Výsledky: Celkem bylo sekvenovano 2278 miRNA, ale do analýzy bylo zahrnuto 658 miRNA, ktere byly exprimovany u vsech vzorků a měly nejmeně 20 cteni. Expresni data byla generovana pomoci Chimira tool z fastq dat. Vsechny sekvence byly mapovany pomoci miRBase v20. Dalsi analýzy byly provedeny s použitim R/Bioconductor package.  Pro normalizaci exprese byl použit Bayesův postup. P hodnoty byly adjustovany s použitim Benjamini-Hochberg metody. Analýza prokazala, že existuje 10 miRNA (p<0.0005), ktere jsou statisticky signifikantně exprimovany u EM vs. MM pacientů – konkretně se jedna o miR-26a-5p, miR-26b-5p, miR-30e-5p, miR-424-3p, miR-503-5p, miR-767-5p, miR-105-5p, miR-5695-5p, miR-450b-5p, miR-92b-3p. Tyto miRNA budou dale ověřeny metodou qPCR na větsim souboru pacientů s MM a EM. Zavěr: Nase pilotni studie ukazala, že existuje rozdil expresnich hladin některých miRNA mezi skupinou pacientů s MM a EM.