СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ N-КОНЦА МЕТАКРИЛАТРЕДУКТАЗЫ БАКТЕРИИ GEOBACTER SULFURREDUCENS AM-1

Сравнительный анализ аминокислотной последовательности N-конца метакрилатредуктазы (50 кДа) анаэробной бактерии Geobacter sulfurreducens AM-1 выявил ее значительное сходство с участками флавоцитохромов с и флавинсодержащих белков у бактериальных анаэробных представителей родов Anaeromyxobacter, Campylobacter, Desulfatibacillum, Desulfuromonas, Geobacter, Parasutterella, Shewanella, Sulfurospirillum, Sutterella, Wolinella, относящихся к четырем классам отдела Proteobacteria; Denitrovibrio отдела Deferribacteres; Desulfitobacterium отдела Firmicutes; Eggerthella и Slackia отдела Actinobacteria; Spirochaeta отдела Spirochaetes. Кроме того, высокая гомология была обнаружена между аминокислотной последовательностью метакрилатредуктазы и флавопротеинами аэробных бактерий родов Frankia и Gordonia отдела Actinobacteria и археи Haloterrigena turkmenica отдела Euryarchaeota. В работе подчеркивается, что среди 11 бактерий рода Geobacter с известными геномами только у способного к “хлородыханию” G. lovleyi SZ был обнаружен аминокислотный фрагмент флавоцитохрома с, обладающий выраженным сходством (80%) с N-концом метакрилатредуктазы. Рассматриваются общие для обнаруженных бактерий свойства. Анализируются расчетные молекулярные массы, возможные функции и локализация в клетке гомологичных белков. Обсуждается соответствие группирования выявленных протеинов в дендрограмме филогенетической принадлежности их носителей. Высказываются предположения о широте распространения и эволюционной значимости подобных белков для микроорганизмов.