Abundance estimates of the Eastern Canada-West Greenland bowhead whale (Balaena mysticetus) population based on genetic mark-recapture analyses

2015 
We conducted Bayesian analyses of genetic capture-mark-recapture data to estimate abundance of the Eastern Canada-West Greenland (EC-WG) bowhead whale population. We employed two different analytical approaches, one that ignored location data and treated the entire data set as one large capture-mark-recapture data set, and another that used locationspecific data to explicitly account for the presence of unsampled areas. For both approaches we conducted analyses based on two different data sets, one containing data from throughout the entire study period (19 years), and the other containing a 5-year subset of the data. The rationale was that the population size may have changed throughout the 19 years of sample collection, which would bias subsequent estimates. A total of 1,177 samples, from 9 locations throughout the distribution, were genotyped at 21 microsatellite loci. Of these, 992 unique genotypes were identified, with 49 recaptures occurring between years and/or locations. Both estimates for the 5-year data set were smaller than for the 19-year data set, which is consistent with a population increase throughout the study period. Although the estimates differ for each approach, our best estimate of total population abundance is 7,660 individuals (95% HDI 4,50011,100). We also obtained location-specific estimate for four areas: Greenland (2,854, 95% HDI 1,230-6,460); Igloolik (2,760, 95% HDI 1,980-5,050); Pangnirtung (3,500, 95% HDI 1,7004,960); and Repulse Bay (38, 95% HDI 20-124). Estimations de l'abondance de la population de baleines boreales (Balaena mysticetus) de l'est du Canada et de l'ouest du Groenland d'apres des analyses genetiques par marquage-recapture RESUME Nous avons effectue des analyses bayesiennes de donnees genetiques obtenues par capturemarquage-recapture afin d'estimer l'abondance de la population de baleines boreales de l'est du Canada et de l'ouest du Groenland. Nous avons utilise deux approches analytiques differentes : une qui ne tenait pas compte des donnees sur l'emplacement et considerait l'ensemble des donnees comme un seul grand ensemble de donnees de capture-marquage-recapture, et une autre qui utilisait les donnees d'un emplacement precis pour tenir compte explicitement de la presence des zones non echantillonnees. Dans le cadre des deux approches, nous avons effectue les analyses en fonction de deux ensembles de donnees differents. Le premier contenait des donnees obtenues pendant toute la periode d'etude (19 ans) et le deuxieme contenait un sous-ensemble de donnees recueillies sur cinq ans. Cette facon de faire se justifie par le fait que la taille de la population peut avoir change au cours de la periode d'echantillonnage de 19 ans et qu'un tel changement pourrait entrainer un biais dans les estimations subsequentes. Un total de 1 177 echantillons, preleves dans neuf emplacements dans l'aire de repartition, ont ete genotypes a 21 locus microsatellites. Parmi ceux-ci, 992 genotypes uniques ont ete identifies et on a procede a 49 recaptures d'une annee et d'un emplacement a l'autre. Les deux estimations obtenues pour l'ensemble de donnees sur cinq ans etaient inferieures a celles obtenues pour l'ensemble de donnees sur 19 ans, ce qui denote une croissance de la population pendant la periode d'etude. Bien que les estimations different dans chaque approche, notre meilleure estimation de l'abondance de la population totale est de 7 660 individus (intervalle de densite le plus eleve [IDE] a 95 % = de 4 500 a 11 100). Nous avons egalement obtenu des estimations pour des emplacements precis dans quatre zones : Groenland (2 854, IDE a 95 % = 1 230 a 6 460), Igloolik (2 760, IDE a 95% = 1 980 a 5 050), Pangnirtung (3 500, IDE a 95% = 1 700 a 4 960) et Repulse Bay (38, IDE a 95% = 20 a 124).
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