O Papel de Carboidratos na Função Proteica: O Caso das PGHSs

Estima-se que em torno de metade das proteinas existentes na natureza sejam glicosiladas. Ao ligarem-se as proteinas, os carboidratos podem alterar diversas de suas propriedades, tanto fisico-quimicas quanto biologicas, tornando-se fundamentais no entendimento de suas funcoes e, como consequencia, na sua modulacao com finalidades terapeuticas. Uma das formas de obtermos informacoes acerca d o papel da porcao sacaridica de uma glicoproteina envolve o estudo da estrutura tridimensional destas biomacromoleculas, por exemplo, atraves de calculos de modelagem molecular, particularmente simulacoes de dinâmica molecular. Nosso grupo de pesquisas vem se dedicando ao desenvolvimento e a validacao de abordagens de baixo custo computacional e baseadas em ferramentas gratuitas capazes de contribuirem para o entendimento de fenomenos biologicos. Estes procedimentos serao apresentados a seguir, tomando como exemplo as enzimas denominadas Prostaglandinas Endoperoxido Sintases, em suas isoformas 1 e 2. DOI: 10.5935/1984-6835.20110033