Determinação da estrutura de proteínas usando restrições derivadas de ligação cruzada em espectrometria de massas

Sistemas biologicos trabalham como maquinas complexas e altamente coordenadas e, desde o surgimento da Biologia Estrutural, muitos mecanismos e estruturas biologicas foram elucidados. A quantidade consideravel de conhecimentos que vem se gerando nessa area devem-se a aplicacao de metodos experimentais associados a metodologias computacionais que permitem compreender a dinâmica estrutural de sistemas biologicos. Metodologias computacionais de modelagem molecular, que utilizam as distâncias experimentais como restricoes para a determinacao estrutural das macromoleculas, usando potenciais estatisticos, modelos baseados em estrutura (SBM) ou metodos de determinacao inferencial de estruturas (ISD). O ISD tem se destacado como um metodo de alta resolucao para determinacao de estruturas terciarias e quaternarias de proteinas a partir de dados experimentais de espectroscopia de ressonância magnetica nuclear (RMN) e de massas empregando ligacoes cruzadas (XL-MS). No presente trabalho foi possivel observar que a alta resolucao obtida provem da combinacao de tecnicas computacionais que empregam inferencia bayesina, obtendo parâmetros e modelos de maior precisao, e tambem de simulated annealing, obtendo maiores espacos conformacionais.