Diversité génétique et diversification chez la levure pathogène opportuniste Candida albicans

Candida albicans est une levure commensale de la flore gastro-intestinale de l'homme. C'est egalement un des principaux organismes pathogenes opportunistes fongiques. La population de C. Albicans est structuree en clades. Le travail de these presente dans ce manuscrit est consacre a l'etude des evenements moleculaires qui sous-tendent la diversite intra- et inter-clades chez C. Albicans. Nous avons montre que la diversification des isolats au cours du commensalisme fait frequemment intervenir des evenements de recombinaison conduisant a de larges pertes d'heterozygotie (LOH). Par ailleurs, nous avons mis en evidence un exces d'heterozygotie dans la population, suggerant l'existence d'un mecanisme de contre-selection des LOH. De plus, nous avons demontre que les echanges genetiques entre les clades et au sein des clades sont rares et que, par consequent, les clades ne constituent pas des especes cryptiques. Une etude exhaustive de la variabilite genomique au sein de l'espece a montre que les souches de C. Albicans peuvent differer par un nombre significatif de SNPs et d'insertions/deletions impliquant majoritairement des elements transposables et des sequences repetees en tandem. Enfin, et de facon importante, nous avons montre que la distribution de ces indels est hautement correlee avec la structuration de la population en clades. L'ensemble de ces resultats a contribue a une meilleure comprehension de la diversite genetique et des mecanismes de diversification au sein de l'espece C. Albicans.