Gene expression profiles to predict outcome in breast cancer

Metodo de clasificacion de un subtipo intrinseco de cancer de mama en una muestra de prueba que comprende: a) obtener un perfil de expresion genica para cada una de una pluralidad de muestras de cancer de mama de entrenamiento que se han clasificado segun el subtipo intrinseco de cancer de mama, en el que cada uno de los subtipos intrinsecos luminal A (LumA), luminal B (LumB), de tipo basal (basal), enriquecido en HER2 (HER2) y de tipo normal (normal) esta representado en la pluralidad de muestras de cancer de mama, y en el que el perfil de expresion genica se basa en la expresion de al menos 40 de 10 los genes intrinsecos enumerados en la tabla 1; b) usar un algoritmo para construir perfiles de expresion genica o "centroides" para cada uno de los subtipos intrinsecos de cancer de mama en el conjunto de entrenamiento; c) obtener un perfil de expresion genica para dicha muestra de prueba, en el que el perfil de expresion genica se basa en la expresion de los mismos al menos 40 genes intrinsecos enumerados en la tabla 1 tal como se usan en la etapa a); d) comparar el perfil de expresion genica de la muestra de prueba con los centroides construidos en la etapa (b); e) calcular la distancia del perfil de expresion genica de la muestra de prueba a cada uno de los centroides; y, f) asignar la muestra de prueba a uno de los subtipos intrinsecos de cancer de mama basandose en el centroide mas cercano.